在生物信息学与系统生物学的前沿战场,Cytoscape 宛如一把利刃,专为蛋白质互作、基因调控等生物网络研究量身打造。它以交互式可视化和插件扩展,让复杂数据挖掘变得轻松简单。

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其核心优势在于动态网络建模与多维度分析,覆盖从数据导入到科学发现的全流程。

以下是它的核心功能亮点:

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  • 网络构建:导入基因 / 蛋白互作数据,自动生成可缩放的交互式网络图谱,分子关系一目了然。
  • 聚类分析:内置 MCODE、CytoCluster 等插件,快速揪出关键模块与枢纽节点。
  • 功能富集:整合 GO/KEGG 数据库,一键注释节点生物学意义,轻松揭示分子功能。
  • 多组学整合:兼容 TSV/Excel 格式,转录组、蛋白质组等多维数据完美融合。
  • 脚本扩展:支持 R/Python 插件开发,可按需定制复杂分析流程。

Cytoscape 凭借强大功能与灵活扩展,为科研人员开辟了生物网络研究的便捷通道,助力攻克科研难题。

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